Molecular Operating Environment破解 Molecular Operating Environment(MOE) v2022.02 64位 许可授权激活版(附补丁+教程)

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Molecular Operating Environment破解 Molecular Operating Environment(MOE) v2022.02 64位 许可授权激活版(附补丁+教程)

2022.2新功能

1、新增功能! 显卡信息。教育部 |帮助 |GPU 信息打开新的 报告哪个 GPU 设备(默认设备)的 GPU 信息面板 将用于 GPU 计算。GPU 驱动程序和计算能力 显示版本,知识兔以及内存,时钟速度,数量 多处理器、CUDA 内核数量和 GPU UUID。兼容性 还指示了MOE GPU加速的应用程序。

2、 碳水化合物 检测和描述。知识兔支持碳水化合物检测和 已添加显示。

聚糖符号命名法 (SNFG) 表示。检测到的碳水化合物可以使用SNFG描述 符号。

更新了卡波.mdb。$MOE/lib/carbo.mdb 已更新,知识兔以涵盖 SNFG 中的所有碳水化合物 命名法。

碳水化合物生成器。碳水化合物构建者 (教育部 |编辑 |构建 |碳水化合物) 已更新如下:

·添加了 SNFG 符号显示。

·碳水化合物生成器现在是可连接/可拆卸的。

3、数据库查看器 显示。数据库查看器具有新的分子显示 功能,知识兔还支持图形对象的显示。

显示 |分子菜单面板。显示器 |分子菜单有 被一个面板所取代,其中分子、氢和 可以设置标签显示模式。

碳水化合物分子显示。碳水化合物展示 添加了自动碳水化合物的模式 使用 SNFG 符号检测和显示。

仅序列分子显示。仅序列显示 添加了蛋白质和核酸的模式 显示为 FASTA 格式的序列数据。

极氢显示。仅显示极性氢的选项。

手性显示。显示原子的选项 具有键楔和手性标记的立体化学; 仅适用于以 2D 形式显示分子时。

分子名称。分子名称的显示为 现在默认启用。

每个字段的统一视图。统一视图模式现已启用 来自 DBV |分子字段弹出菜单,仅适用于当前字段;选项是 仅在 3D 显示模式下可用。

DBV 碳水化合物和格劳博显示器

显示图像和图形对象。字符 包含 PNG 图像或 MOE 图形对象 (grob) 数据的字段 编码为字符串将自动显示 grob/png 图像。

缩放和翻译。2D、碳水化合物、格罗布和巴布亚新几内亚 图像可以使用 Ctrl+中键拖动进行缩放并使用 中拖。

4、数据库查看器 找到。DBV 搜索功能已增强如下:

单个查询中的多个搜索条件。多个数字 和文本搜索(例如 >10 <30)现在可以 在同一查询行中指定; 这在搜索所有字段、数字时很有用 字段或文本字段。

用于组合搜索条件的 And 和 Or 模式。什么时候 单个搜索行中存在多个条件,并且知识兔要求满足所有条件才能成功匹配, 而 Or 只需要一个就可以满足。

搜索数值向量。对于包含以下内容的数据库单元格 数值的向量,单元格中只有一个值是 需要在 And 或 Or 模式下匹配才能成功 搜索。

通配符文本搜索现在是可选的。通配符在 文本字段搜索现在是可选的。匹配选项有 已更新为:

·部分。启用后,子字符串完全匹配 执行。

·通配符。启用后,将解释搜索文本 使用 findmatch 语法执行搜索。禁用后,特殊字符(例如 * 或 [ )将不 被视为通配符。

·案例。启用后,搜索区分大小写。

5、数据库查看器 情节。数据库查看器图现在是 SVL 面板, 并具有以下新功能。

指定打印类型。绘图类型 – 数据 绘图(对应于以前的默认绘图类型)、相关图、字段直方图 – 是 现在在使用 DBV |页脚 |剧情。

连接/分离功能。现在可以分离 DBV 图 并重新连接。

多个情节。由于DBV图可以分离,因此多个 现在支持绘图。

缩放和翻译。滚轮可用于 缩放绘图显示,中键拖动可用于移动 以 X 和 Y 显示。

取消。按住 Ctrl 键单击将取消选择绘图点。换档拖动 扫描与当前 AND 相关的选择矩形 选择;即,结果选择将是 已选中,并且知识兔属于“班次选择”区域。

绘制所选字段。DBV 中的新选项 |绘图弹出窗口重置 图以显示当前选定字段中的数据 数据库查看器。

相关图

对数刻度。剧情中 |弹出窗口 | “设置”面板,缩放 |对数是一个新选项 在数据轴上打开日志缩放;即 Y 轴 数据图,知识兔以及相关图中的 X 轴和 Y 轴。

气泡中的配体描述帮助。泡沫帮助 在绘图点上现在显示配体描述除了 图中显示的字段的值。

知识兔双击以滚动到条目。知识兔双击绘图 点将滚动条目显示以带来相应的 进入视野。

6、数据库查看器 打印。数据库查看器打印工具分享 以下更新:

支持混合 PNG、图形对象、碳水化合物、2D 和 3D 显示。知识兔双击包含 图像或图形对象打开 “导出图像”面板。

滚动条已添加到打印预览。

摩尔风格。显示碳水化合物的新选项 使用(SNFG)表示;将显示非碳水化合物 在 2D 模式下。

使用现有 2D 坐标。新选项;仅在以下情况下启用 数据库单元格包含预先计算的 2D 坐标。

显示手性。显示原子的新选项 使用键楔和手性标记进行立体化学 启用;仅适用于以 2D 形式显示分子时。

显示所有氢气。显示全部的新选项 显示原子上的氢。

不要给杂原子上色。重铸前一个 “彩色原子”。默认情况下,该选项处于禁用状态。

7、数据库查看器 分子名称。数据库分子命名选项已 添加如下:

自动命名选项。数据库分子名称可以 现在自动设置为链名称、链标签或自动(使用第一个非空链标签,否则使用链名)。

设置数据库分子的选项 数据库中分子创建的名称已添加到 新建数据库,添加条目,并从MOE面板中复制分子。

分子名称。DBV |计算 |分子 |“分子名称”面板已更新如下:

·分子提取物有一个新的链标签选项。

·“分子存储”已更新为新的“标记”和“名称”选项,该文本字段用于 为“连接到现有名称”选项指定名称后缀, 以及用于使用 设置 来自数值字段的分子名称。

8、数据库查看器 着色。“数据库查看器字段着色”面板已得到增强 如下:

简化布局。面板设计已简化 易于使用。

DBV 菜单面板。字段着色面板现已打开 直接在菜单中,但可以作为独立面板分离。

多箱范围规格。新的箱着色模式 具有可配置数量的箱,由两个端点指定 的范围和每个箱的中点值。数据库单元 其值落在给定的箱中由箱颜色着色;即 没有梯度。值在箱外的单元格 范围不着色。

渐变和对数渐变着色。前者范围/坡道 功能已更新为使用可配置数量的箱, 与多箱范围规范类似。每个垃圾箱都是 在条柱中点指定颜色,并在范围内指定颜色 是插值的。超出范围的值是 分配了端点的颜色。

自动范围设置。范围的端点和 可以从电流中自动检测梯度规格 按刷新按钮的数据库字段值。

撤消。用于撤消上次着色操作的新按钮。

定制。用于保存当前颜色规则的新按钮 在自定义名称下,或加载保存的规则。

非空单元格的颜色规则。非空 已 添加到单元格着色选项,知识兔以应用着色 非空单元格的规格。

控制 DBV 文本颜色的新选项已添加到 “配置选项”面板的“数据库查看器”页。反转文本颜色 在深色背景上,启用后,反转文本/前景色 当单元格具有深色背景色时。这可能会使文本更多 当字段着色使单元格背景变暗时可读。

9、数据库 浏览器。数据库浏览器已更新如下:

碳水化合物显示已添加为新的 2D 模式。

新的 Pocket 选项已添加到 Dock 浏览器中:

袖珍视图。启用选项启用/禁用 口袋视图。禁用时,浏览的受体结构 被隐藏并变得惰性。

受体碳着色。复选框现在启用/禁用 受体的碳原子着色。默认颜色 是深绿色的。

配体渲染样式。新的配体渲染选项允许 对配体进行着色(默认为亮绿色)并更改 原子/键显示模式。复选框启用/禁用配体 原子渲染。配体渲染仍然可以使用 教育部 |页脚呈现控件。

浏览结构的单独标记。浏览的结构是 现在分配了自己的标签,这是原始标签后缀 “浏览器。”保留结构时 (保留 |受体或配体),即 标记将恢复为原始标记。

浏览的原子集。浏览的结构现在已添加到 设置“浏览器原子”

RC 变量。RC 变量 dbbrowse.tag.suffix 和 dbbrowse.tag.suffix.dbbrowse_Dock 控制后缀 用于浏览的结构标记。

10、数据库 计算器。选项 将 0 用于空单元格具有 已添加以将空单元格视为 0 以进行逐行操作。

11、数据库 菜单。用于编辑和选择的数据库查看器菜单已更新

12、 情节。

相关图。新的回归线模式已 添加到数据库查看器相关图中。

现在可以使用二次、对数、指数和幂回归线。

新的自动选项选择回归线 最适合数据的类型。

相关图现在支持绘制第三个和第四个 数据字段,第三个数据字段使用颜色显示 范围,知识兔以及使用数据点大小显示的第四个数据字段。

二面体等值线图

二面体等值线图。二面体等高线图已被 更新。请注意,它在菜单中的位置已更改为 MOE |计算 |构象 |两面角 等值线图。

当前角度标记。现在显示一组十字准线 在图中指示当前二面角值。

从绘图设置二面角。知识兔点击绘图将 在MOE中设置分子中的二面角。

预设二面角。二面角可以是 通过在教育部系统中选择两个债券来预先指定 在启动应用程序之前。

3D 窗口中的二面角计。两面角 角度计显示在分子上 在 MOE 3D 绘图区域中显示哪个 二面角正在探索中。

二面体。新按钮允许重新定义二面体 角度并更新情节。

更新。用于重新计算绘图的新按钮。

出口。新建按钮以打开“导出”面板。

13、图形对象导出。通过打印导出图形对象 |导出页面 已通过以下功能进行了增强:

复制到剪贴板。

剪贴板 PNG 已添加格式选项。剪贴板内容可以粘贴到数据库查看器字符中 将自动显示 grob 的字段单元格。使用 MOE |页脚 | |复制 图片也可以粘贴到数据库查看器中。

剪贴板格劳博已被 添加到格式选项,并将放置 grob, 编码为字符串,按下 OK 时到剪贴板上。剪贴板内容可以粘贴到数据库查看器字符中 将自动显示 grob 的字段单元格。

背景透明度。透明背景是 用方格背景表示。启用后,新的“背景”选项允许使用不透明的彩色背景 (默认为白色)要指定。

每个格罗布设置。如果知识兔有多个 grob,则设置 可以单独配置。

14、文件格式。添加了对以下文件格式的支持:

SDF V3000增强型立体化学。知识兔支持 V3000, 允许部分和混合立体化学以及 添加了要指定的立体声组。立体化学 组类型包括:

V3000 立体化学

绝对(ABS)。绝对配置是已知的。

相对 (或)。集合之间的相对配置 的立体声中心是已知的,但绝对配置 莫。因此,该结构表示单个 立体异构体。

外消旋(和)。立体异构体的混合物:一对 对映异构体或所有非对映异构体的集合。

支持V3000立体声编码如下:

增强的 SMILES 立体声注释对 V3000 立体声进行编码。具有数字 ID 的 V3000 立体声集是 由“@”后跟数字表示, 带有“@”和 “@@”表示集合 1 和 2。

MOE mdb分子格式已增强为 编码 V3000 立体声。

用于大型 PDB 文件的混合 36 格式。基地36系统 用于将残基 UID 和原子序列号扩展到 现在支持默认 PDB 格式施加的 5 位限制。该系统向后兼容标准 PDB 编号。

RCSB Search API v2.教育部已迁移到使用版本 2 RCSB PDB 搜索 API,于 13 年 2022 月 <> 日发布。

教育部项目中的毫米CIF。教育部项目数据库现在直接 支持使用 mmCIF 文件。RCSB mmCIF 分布为 现在是项目数据库的主数据源和 具有回退的项目数据库更新应用程序 如果知识兔 CIF 文件不可用,则到 PDB 文件。

PDB 琥珀色 22.AMBER22 选项已添加到“文件”|”保存 |要使用的蛋白质数据库 写出 PDB 文件时的新琥珀色 ACE/NME 原子命名方案。

PRMTOP OBC。文件 |保存 |琥珀色拓扑 文件现在写入 OBC (igb5) 隐式溶剂参数 到琥珀色 PRMTOP 文件。

15、 电子密度在 应用程序。DSN6 映射和 CIF 结构因子已支持 添加到能量最小化和停靠。

16、2D 叠加。教育部 |页脚 |2D 叠加已更新 如下:

标签名称已添加到显示中。

现在显示连接点和 R 组。

下一个和上一个按钮在最后一个或第一个结构时换行 已达到。

17、质子酸3d。添加了对 U(尿嘧啶)的支持。

18、扭转曲线。添加了新的“计算费用”选项。

19、部件。对组成微件进行了以下更新 板。

范围滑块。这个新的小部件分享了一个双拇指 表示具有开始值和停止值的值范围的滑块。

在拇指之间单击拖动将导致两个拇指 要拖动,知识兔从而保留 他们。

鼠标滚轮或左键单击左侧或右侧 范围区域将两个拇指移动一个滑块单元。

中键单击移动两个拇指,尝试定位 单击范围中间的点。

使用 Ctrl 键修改鼠标单击可移动最接近的鼠标 拇指本身。

“滑块值”。启用后,显示在 拇指与拇指关联的值。鼠标悬停时 在值上,左键单击将打开一个文本字段,其中 以显式设置值。

Z 剪裁设置

Z 剪裁(教育部 |页脚 |ZClip)现在 使用范围滑块进行分子和表面剪切。

滑块。

“滚动条”。滑块样式的此新值以滚动条样式显示滑块。

“滑块值”。启用后,显示在拇指附近 与拇指关联的值。将鼠标悬停在 值,左键单击将打开一个文本字段,在其中设置 显式值。

绘图小部件。SVL 绘图微件已更新:

线条和标记样式。新线(实光、“虚线光”、“虚线光”)和标记 (“圆点”、“细十字”)样式 已添加。

3D 和 4D 散点图。散点图现在可以显示 三维或四维系列数据。3d 维度使用颜色 斜坡来限定绘图点,第 4 维使用大小。在“打印属性”弹出面板中,Z 轴表示 第 3 维(如果知识兔使用)和第 W 轴第 4 维(如果知识兔使用)。和

对数显示。对数显示模式选项 已添加到“绘图属性”面板/弹出窗口中 轴选项卡。

20、 PSILO 查询。教育部的PSILO页面 |文件 |打开面板 已更新为包含数据库作为标识符,兼容 使用新的PSILO联合数据库框架。查询的结果 是数据库内容的列表。

21、第三方软件。教育部 2022.02 支持:

高斯 g16 c.01

MOPAC2016

NAMD 2.14

22、萌萌菜单。对 MOE 菜单进行了更改。

安装激活教程

1、在知识兔下载并解压,如图所示

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2、安装程序,勾选我接受许可证协议条款

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3、知识兔选择.dat文件

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4、安装完成,将破解的exe文件复制到安装目录中,替换

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5、确认license.dat 是否在C:\Program Files\moe2022中,如果知识兔不在,请从破解文件夹中复制到该位置闪电知识兔小编说明:领先的工作流,3D分子可视化、基于结构的设计和预测、抗体和生物制剂设计、快速搜索配置、可视化的蛋白质和DNA/RNA 建模、分子模拟等等,功能齐全,界面友好!

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